Në këtë Njësi monitorohet rregullshmëria shëndetësore e ujit të pijshëm, në pajtim me rregulloret ligjore, rregullshmëria shëndetësore e ujërave minerale (të ambalazhuara); cilësia higjienike e ujërave të zeza sipërfaqësore dhe të ndotura nga aspekti shëndetësor-ekologjik, me ndihmën e analizave kimike sanitare (analiza kimiko-toksikologjike).

Kjo Njësi është e akredituar (sipas ISO/IEC 17025:2005) për përcaktimin e parametrave fiziko-kimikë në të gjitha llojet e ujërave.

Njësia është e pajisur me një instrument për kromatografi jonike IC Dionex Aquion për përcaktimin e anioneve dhe kationeve të tretura në ujë.

Në këtë Njësi kryhen këto metoda të akredituara:

1. Përcaktimi i рН (МКC ISO 10523:2008);
2. Përcaktimi i përçueshmërisë elektrike (ISO 7888);
3. Përcaktimi i indeksit të permanganatit (Konsumi i КMnO4) (ISO 8467);
4. Përcaktimi i klorideve sipas Mohr (ISO 9297);
5. Përcaktimi i alkalinitetit (total-m, përbërës-p dhe alkaliniteti karbonat) (ISO 9963-1)
6. Përcaktimi i sasisë së kalciumit dhe magneziumit –metoda titrimetrike ЕDTA (ISO 6059)
7. Përcaktimi i kalciumit - metoda titrimetrike ЕDTA ( ISO 6058)
8. Përcaktimi i ngjyrës me fotometër ( MKC EN ISO 7887:2013)
9. Përcaktimi i sasisë së përgjithshme të mbetjeve të thata të tretura në 105°С, 180°С dhe 260°С (Metoda standarde e ekzaminimit të rregullshmërisë higjienike)
10. Përcaktimi i аnioneve në ujë me kromatografi jonike (fluoride, kloride, nitrite, bromide, nitrate, fosfate dhe sulfate) ( MKC EN ISO 10304-1:2013)
11. Përcaktimi i katjoneve në ujë me kromatografi jonike (litium, natrium, kalium, amonium, magnez dhe kalcium) ( MKC EN ISO 14911:2009)
12. Përcaktimi i hekurit me fotometër (MKC EN ISO 6332:2007)
13. Përcaktimi i manganit me fotometër (MKC EN ISO 6333:2007)